波多野结衣AV高清一区二区三区|日韩精品久久久久网站|99re免费视频国产在线播放|国产手机在线αⅴ片无码观看|

服務熱線02152235399
當前位置：首頁 > 科學研究 > 新聞動態(tài)
定制化科研服務——交給烈冰，做您所想 時間：2017-12-27

烈冰科技創(chuàng)始至今，每一個項目圍繞客戶需求展開，定制最適合的方案，只要您有需要，烈冰就為您出力。我們竭盡全力讓每一個信任我們的客戶滿意，并花費大量人力、物力和時間。烈冰擁有一支具有一流水平的生物信息分析團隊，旨在高效率提供標準流程化的生物信息分析，同時根據(jù)不同的項目需求，提供定制化的深度數(shù)據(jù)挖掘服務。當然除了數(shù)據(jù)分析外，烈冰的團隊也可以為研究者的課題做出嚴謹?shù)慕ㄗh。烈小冰覺得，比起所謂的價格優(yōu)勢，時間優(yōu)勢，物超所值或者至少物有所值才是更重要的，這也是烈冰的服務宗旨，以客戶為根本，提高客戶幸福感。

網(wǎng)絡圖太難、種類太多難以選擇？烈冰幫你搞定

基因互作網(wǎng)絡

研究中，常常會發(fā)現(xiàn)差異基因過多，并且所屬信號通路也很復雜，難以將相關基因聯(lián)系起來并找到“核心”基因。烈冰團隊整合基因間相互作用關系，并采用網(wǎng)絡圖展示差異基因間復雜的互作網(wǎng)絡/信號傳遞網(wǎng)絡，幫助研究者快速定位到“核心”基因。

Sun L et al., Sci Rep, 2016

共表達網(wǎng)絡

對于已知注釋信息進入深入的分析挖掘之后，研究者往往希望能夠找到更多的創(chuàng)新點。烈冰團隊基于轉錄組基因的實測表達值，為研究者構建基于統(tǒng)計學和“圖論”原理的共表達網(wǎng)絡，通過研究處理前后共表達網(wǎng)絡拓撲結構變化，了解基因間的潛在關系和規(guī)律，進一步找到實驗處理前后發(fā)生改變的關鍵基因進行深入研究。

Zhang et al., Arch Toxicol, 2013

GO-Tree分析

在得到差異基因及其顯著富集的GO功能條目后，烈冰團隊為研究者構建并提供GO-Tree功能樹，通過該分析，研究者可以清晰的總結研究的核心基因所影響的生物學過程。

Miao et al., Mol Cell Endocrinol, 2015

可變剪接驗證率太低很苦惱？烈冰幫你搞定

烈冰團隊早在2014年即自主研發(fā)了高驗證率可變剪接算法ASD （Alternative Splicing Detector，網(wǎng)址：http://m.edatabond.com/asd/ASD.html），該算法發(fā)布后即被大量文獻引用，其中不乏Nature Communications、PloS Genetics 等高分期刊。17年烈冰研發(fā)總監(jiān)宗杰博士率生物信息研發(fā)團隊開發(fā)的“進階級”可變剪接分析算法CASH（Comprehensive AS Hunting，網(wǎng)址:https://sourceforge.net/projects/cash-program/），無論在有生物學重復還是無生物學重復樣本中，CASH都顯著提升了樣本之間差異可變剪接事件的檢測能力，尤其是新的可變剪接事件，驗證準確率高達70%！在針對不同測序深度數(shù)據(jù)的測試中，CASH始終表現(xiàn)出優(yōu)于其他算法的檢測率。即使是在低數(shù)據(jù)量下，CASH依舊力壓其他算法，始終維持著極高的敏感性及特異性。

CASH算法檢測效率驗證

烈冰團隊利用Flux模擬器模擬了一系列數(shù)據(jù)，其中包含已有注釋的以及新的差異可變剪接事件，測序深度分為30x，50x和100x。結果顯示MISO，rMATS以及DEXSeq在使用重建后轉錄本的情況下，其檢測效率要高于使用參考基因組，但還是顯著低于CASH。即使是在30x的數(shù)據(jù)量下，CASH依舊能夠維持著極高的敏感性及特異性。

Wu et al., Brief Bioinform, 2017


烈冰團隊一研究不夠深入？烈冰幫你搞定

ceRNA分析

lncRNA可作為ceRNA（competing endogenous RNA，競爭性內(nèi)源RNA）與miRNA相互作用，參與靶基因的表達調(diào)控，并在多種疾?。ɡ绾芏鄬W者研究的腫瘤）的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用。烈冰團隊整合多種算法，協(xié)助研究者完成lncRNA-miRNA-mRNA互作網(wǎng)絡圖，直觀的展示這三者之間的調(diào)控關系。

Miao et al., Sci Rep, 2016

circRNA也可以作為ceRNA（competing endogenous RNA，競爭性內(nèi)源RNA）與miRNA結合，影響基因的調(diào)控表達。烈冰團隊協(xié)助研究者對其進行分析，從而進一步研究circRNA對基因表達的調(diào)控作用。

Huang et al., Nat Commun, 2016

甲基化-mRNA聯(lián)合分析

基因啟動子區(qū)甲基化能影響基因表達，可變剪接位點甲基化影響基因可變剪接發(fā)生，轉座子區(qū)甲基化影響轉座子活動，種種因素使得很多研究者對甲基化和轉錄組的聯(lián)合分析很感興趣，烈冰的生信團隊會根據(jù)項目情況，設計最合適的研究切入點，協(xié)助研究者找到關鍵基因。

Spencer DH et al., Cell, 2017

小RNA和甲基化相關性分析

小RNA和甲基化之間的聯(lián)系也相當緊密，如小RNA產(chǎn)生位點基因啟動子區(qū)DNA甲基化影響小RNA表達，小RNA通過調(diào)控甲基轉移酶影響基因甲基化水平等，烈冰團隊會根據(jù)客戶實際研究，設計最佳生信分析方案。

Coruh et al., Plant Cell, 2015

樣本過于復雜難以下手分析？烈冰幫你搞定

WGCNA功能預測

WGCNA（Weighted Gene Co-expression Network Analysis，加權基因共表達網(wǎng)絡）是一個基于基因表達數(shù)據(jù)，構建基因共表達網(wǎng)絡的方法。烈冰團隊協(xié)助研究者利用WGCNA進行功能預測，根據(jù)基因表達模式，將基因進行分組。例如在circRNA的功能研究中，可以根據(jù)“凡是能夠互相形成共表達關系并且成簇的基因，具有類似的功能”，認為circRNA和它所屬簇中mRNA具有類似的功能，并且可以通過mRNA所富集功能和信號通路對circRNA對于表型的影響進行預測。

Wang et al., Frontiers in plant science, 2017

烈小冰介紹得比較粗略，也不夠全面，要是感興趣，可以直接聯(lián)系我們的銷售詳細咨詢，您專屬的方案咨詢顧問會為您設計定制化方案。

烈冰服務流程

其實，說到定制化，烈小冰要再為大家推薦烈冰團隊耗時8年開發(fā)的NovelBrain®云計算平臺。該平臺是行業(yè)內(nèi)實現(xiàn)高度定制化分析的云計算平臺，烈冰科技充分考慮到了生物信息大數(shù)據(jù)分析的復雜性和特殊性，NovelBrain®云計算系統(tǒng)不僅能新建或修改工作流，而且能在分析運行前、運行中、運行后均可任意修改和運行分析流程，并保證分析過程可追溯和可重現(xiàn)，真正實現(xiàn)生物大數(shù)據(jù)分析的高度定制化。

烈冰的服務沒有太多華麗的噱頭和頻繁促銷，我們把所有的精力都投入到了精益求精中，給客戶更優(yōu)質(zhì)的服務。您有需求，烈冰幫您完成，以客戶為根本，提高客戶幸福感，烈冰一直都是這樣堅持的，以后也會繼續(xù)堅持。如果您有任何關于實驗或生信的想法和需求，請直接與當?shù)劁N售或撥打021-51827998與我們聯(lián)系，烈小冰竭誠恭候。